Ich denke auch, daß Drohnen zu gefährlich, zu störanfällig, zu wenig kontrollierbar sind - und auch nicht zur Kultur der Sternenflotte passen.
Man stelle sich nur mal vor, die SF würde eine bewaffnete Drohne losschicken, um einen Gegner zu überwachen. Falls (oder besser sobald) es diesem gelingen würde, die Drohne abzufangen und einzusacken, hätte dieser plötzlich Zugriff auf eben diese verwendete militärische Technologie.
Auf der anderen Seite können Drohnen Raumschiffe überhaupt nicht ersetzen, eine Sternenflotte, die zuhause bleibt und den Weltraum nur mit Drohnen erkundet, halte ich daher für interessant, aber völlig verquer.
Denn Drohnen können a) keine Kultur leben, und b) keine Gemeinsamkeit erzeugen.
Wer mit Drohnen kommt, der ist immer auf Distanz, der zeigt nichts von sich persönlich, der kann also auch keine wirklich persönlichen Bindungen eingehen, der kann kein kulturelles Leben präsentieren oder mit anderen teilen.
Auf genau dieser Gemeinschaft, diesem Teilen mit anderen basiert aber die gesamte Föderation, und im begrenzten Maße selbst die Sternenflotte.